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Epicentre 公司> Epicentre 公司促销产品>TargetAmp™ RNA 扩增试剂盒

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常见问题

1. 用TargetAmp试剂盒扩增RNA时用什么方法提取总RNA比较好?

    多种方法提取的细胞总RNA都可以成功的用TargetAmp RNA扩增试剂盒来扩增。 包括盐析(比如EICENTER’SArrayPure™ MasterPure™ RNA纯化试剂盒),RIzol® / TRI 试剂和离心纯化柱等。但是,很重要的一点是纯化的RNA产物中不能含有抑制RNA扩增反应所需要的酶活性的物质,如盐、金属离子、乙醇和苯酚等。关于RNA纯化的详细信息可以参考随试剂盒提供的TargetAmp Kit产品文献或者访问我们的主页。(www.epibio.com)。

2. 我什么时候该使用TargetAmp 1-Round kit ,什么时候该使用TargetAmp 2-Round Kit? 

    当您要从25-500 ng的总RNA中来扩增目的RNA时你可以选用 TargetAmp 1-Round kit;当您要从10-500 pg的总RNA中来扩增目的RNA时你可以选用TargetAmp 2-Round Ki。关于如何选择的详细信息可以参见http://www.epibio.com/targetamp/targetamp_selection_guide.asp

3. 我可以按比例增加或减少 TargetAmp扩增反应的体系吗?

    我们建议您不要按比例增加或减少 TargetAmp扩增反应的体系。这个体系是最优化的,如果您改变体系,您就可能会损失一些样品或者得到的产量较低。

4. EICENTER公司为什么推荐cDNA第二条链合成的温度为65℃?其它商业试剂盒和文献都用16℃。

    TargetAmp试剂盒中用我们公司独有的,采用获得专利的高速、热稳定的DNA聚合酶来进行cDNA第二条链的合成,而不是一般的嗜温酶。

5. 在第二轮进行cDNA第一条链的合成时EICENTER公司为什么推荐使用SuperScript II而不用SuperScript III?

应用高温反转录(SuperScript III)可以获得更多的全长的cDNA, 应用SuperScript II可以得到更高的产量,在第二轮扩增时,我们希望得到的是高产量,所以在第二轮,我们推荐使用SuperScript II。

6. 应用TargetAmp RNA扩增试剂盒时在哪些步骤我可以停下来?

    第二条cDNA链合成后、体外转录RNA的DNase处理后(aRNA纯化前)和 aRNA纯化后都可以停下来。如果您选择在cDNA停下来的话,您可以将您的样品保存在-20℃。我们通常把我们的aRNA样品保存在-80℃。

7. 如果我增加体外转录反应的次数,会有什么好处吗?

    没有。体外转录反应的次数已经过优化,能产生最大量的长片段的aRNA。如果增加反应的次数,NTP池中NTP的含量会显著下降,而这会导致短片段aRNA产物。

8. 在我完成了一轮扩增或者两轮扩增的程序之后,纯化aRNA或者aminoallyl-aRNA的最好的方法是什么?

    纯化柱的使用取决于您的aRNA或者aminoallyl-aRNA的预计产量。如果预计产量小于40 ug,您可以选用Qiagen MinElute Cleanup Kit (Qiagen cat. no. 74204)来纯化aRNA或者aminoallyl-aRNA。如果产量大于40 ug,可以用Qiagen RNeasy Mini Kit。详细信息可以参阅TargetAmp产品文献。

9. 如果我在一个热循环仪上来进行体外转录反应,反应结束时我能让仪器保持4℃过夜,第二天再接着进行aRNA的纯化吗?

可以,我们通常就是这样做的。

10.  在aRNA纯化步骤中提到:“利用真空泵将离心管中的残存液体抽干”。如果我们没有真空泵,可以通过加长离心时间来代替真空抽干吗?

可以。延长离心时间1-2分钟,观察离心管是否干燥,在管的内表面没有水滴即可。

11.与其它方法直接标记NTP(生物素标记NTP,Cy-NTP或者荧光染料标记NTP)

体外加入转录过程相比,直接产生aminoallyl-aRNA这种方法有什么优点?

    这种间接标目的核酸的aminoallyl方法,正在变得流行起来,因为它相对直接加入生物素或者荧光标记NTP 的方法来说具有更大的优点。包括以下几个方面:

  • 通过RNA扩增反应产生的aminoallyl-aRNA,可以分别根据需要标记不同的NHS-ester。

  • 与直接采用生物素或者荧光标记的NTP相比,Aminoallyl-NTP可以更有效的掺入体外RNA转录成为aRNA,而且相应的aminoallyl-aRNA产量更高。

  • 与直接用生物素,Cy或者荧光素标记NTP相比,将具有胺反应活性的生物素-NHS 、Cy-NHS或者其它荧光素-NHS加入AA-RNA 的方法则更加经济。

  • 价格不是很昂贵的Biotin-X-X-NHS,Cy-NHS和荧光标记的NHS标记物是商品化的试剂,可以买到。

 

 

 

 


 
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